Zentrale Bedeutung besitzt der unter Naturschutz gestellte Bereich der Mündung  der Sieg in den Rhein sowie die angrenzenden landwirtschaftlich genutzten Freiflächen. Die Sieg ist ein landesweit bedeutsamer Fließgewässerkomplex mit naturnahen Strukturen, einer wenig beeinträchtigten Überflutungsdynamik und einer charakteristischen Vegetation. Sie bietet verschiedenste Habitate unter anderem für europäisch bedeutsame Fischarten (zum Beispiel Neunaugen, Bitterling, Groppe) sowie für zahlreiche Rast- und Brutvögel.

Der Planungsraum gliedert sich hinsichtlich seiner Nutzungsform in zwei zusammenhängende Haupteinheiten:

• Den Waldkomplex Ennert im Westen mit naturnahen Bächen und einem relativ hohen Anteil naturnaher, zum Teil traditionell bewirtschafteter Laubwälder. Das Waldgebiet nimmt etwa die Hälfte des Bonner Anteils an der Landschaftseinheit "Pleiser Hügelland" ein. Seine von 180 auf 80 Meter über Normalnull (NN) steil zum Rheintal abstürzende Westkante mit einer Kette aufgelassener Basaltsteinbrüche wird durch die A 59 und B 42 begrenzt.
• Die Hochebene im östlichen Teil mit großflächiger Ackerlandnutzung. In diesem Bereich werden lediglich die Flächen entlang der Bäche als Grünland genutzt.

Darüber hinaus beinhaltet der Planungsraum weitere (Klein-) Strukturen, zum Beispiel Obst- und Kleingartenanlagen, Hangflächen, kleinere Brach- und Waldflächen, eine Waldinsel bei Holzlar (Giersberg), das Wolfsbachtal mit Wald- und Grünlandbereichen und eine angrenzende Ackerfläche bei Hoholz.

Zentrale Bedeutung besitzt der unter Naturschutz gestellte und als Teil des Europäischen FFH-Schutzgebietes Siebengebirge ausgewiesene Bereich des Ennert.

Der Geltungsbereich des Landschaftsplans Kottenforst gliedert sich hinsichtlich seiner Nutzungsform in nachfolgende Haupteinheiten:

• Die Bonner Rheinebene im Norden von Graurheindorf und im Südosten von Mehlem.
• Die Hangbereiche zwischen Poppelsdorf, Friesdorf, Bad Godesberg, Muffendorf und Lannesdorf mit ihren vielfältigen Nutzungsstrukturen und abwechslungsreichen Vegetationsbeständen.
• Die Hauptterrasse im südlichen Plangebiet (Bereich Lannesdorf), die von zum Teil tief eingeschnittenen Löß-Hohlwegen gegliedert wird, zwischen denen sich ein Mosaik aus unterschiedlichen Nutzungsformen findet.
• Die Bachtäler des natürlich mäandrierenden Katzenlochbaches / Lengsdorfer Baches, des Engelbaches (Melbtal), des Wittgesbaches und des Godesberger Baches, die in zum Teil engen und tiefen Einschnitten das Gelände durchziehen und von bewaldeten Seitenhängen, offenen Grünland- und Obstwiesenflächen sowie dichten Ufergehölzen begleitet werden.
• Der Kottenforst (Hauptterrasse) als große zusammenhängende Waldfläche im Süden des Plangebietes, der sich aus verschiedenen Eichen-Hainbuchen-Wäldern und Buchenwäldern zusammensetzt.

Die Unterschutzstellung des Kottenforstes ist begründet durch den ausgedehnten zusammenhängenden Laubwaldkomplex, der aufgrund seiner Größe und Ausstattung eine zentrale Bedeutung im landesweiten und somit europäischen Biotopverbundsystem einnimmt.

Charakteristisch für das Landschaftsschutzgebiet „Rheinufer“ sind angrenzend an den Rhein die großen Wiesen und Parkanlagen. Es dient zum einen dem Schutz der Tiere, Pflanzen und ihrer Lebensräume, die in einer städtisch geprägten Umgebung erhalten und gefördert werden sollen, und zum anderen der Bevölkerung als einer der wichtigsten Naherholungs- und Freizeiträume im Verdichtungsraum Bonn.