Affenpocken sind eine durch Affenpockenviren verursachte Viruserkrankung. Klinisch äußert sie sich vor allem durch Fieber, Kopf- und Muskelschmerzen sowie durch Hauteffloreszenzen, welche simultan die Stadien Macula, Papula, Vesicula und Pustula durchlaufen und letztlich verkrusten und abfallen. Folgen einer überstandenen Infektion sind Narbenbildung und selten auch Erblindung.

Die Krankheit verläuft i. d. R. milder als die klassischen Pocken (Variola-Virusinfektion), aber vor allem bei sehr jungen und/oder immungeschwächten Patientinnen und Patienten kann es gerade in Endemiegebieten auch zu schweren Verläufen und Todesfällen kommen. Eine mögliche Therapieoption, v. a. für immungeschwächte Patientinnen und Patienten, ist seit Januar 2022 auch in der Europäischen Union zugelassen (Tecovirimat), bisher aber nicht breit verfügbar.

Reservoirtiere in afrikanischen Endemiegebieten sind nicht Affen, sondern vermutlich Nagetiere. Infektionen können durch Kontakt mit Sekreten infizierter Tiere übertragen werden (in den USA gab es 2003 einen Ausbruch durch als Haustiere gehaltene Präriehunde, die sich vor ihrem Verkauf in Zoohandlungen durch Kontakt mit Nagetieren aus Afrika infiziert hatten). Mensch-zu-Mensch-Übertragungen (durch Kontakt mit Körperflüssigkeiten oder Krusten) mit limitierten Infektionsketten von bis zu sechs Personen sind beschrieben, z. B. im Rahmen der Krankenversorgung. Auch die Übertragung von Pockenviren im Rahmen sexueller Handlungen ist möglich (für Vacciniavirus beschrieben).

Weite Teile der Weltbevölkerung haben mittlerweile keinen durch die früheren Pockenschutzimpfungen vermittelten Impfschutz mehr.

In afrikanischen Ländern, wie z. B. Nigeria, werden seit 2017 vermehrt Affenpockeninfektionen beim Menschen diagnostiziert, und reiseassoziierte Infektionen bei Nigeria-Rückkehrenden vor allem im Vereinigen Königreich.